Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMC2P35998 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC2P35998 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms