Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP6P35125 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP6P35125 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP6P35125 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP6P35125 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP6P35125 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP6P35125 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP6P35125 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP6P35125 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms