Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFNP31947 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFNP31947 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFNP31947 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFNP31947 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFNP31947 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SFNP31947 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFNP31947 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFNP31947 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFNP31947 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFNP31947 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms