Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA13P31271 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA13P31271 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA13P31271 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms