Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTR2AP28223 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms