Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA2P24043 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA2P24043 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms