Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCP20941 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCP20941 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCP20941 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCP20941 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCP20941 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCP20941 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCP20941 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms