Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCL3P20749 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCL3P20749 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCL3P20749 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCL3P20749 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BCL3P20749 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BCL3P20749 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BCL3P20749 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BCL3P20749 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms