Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms