Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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