Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NGFRP08138 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NGFRP08138 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NGFRP08138 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms