Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms