Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETM1O95202 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETM1O95202 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETM1O95202 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETM1O95202 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETM1O95202 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETM1O95202 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETM1O95202 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETM1O95202 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETM1O95202 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETM1O95202 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETM1O95202 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETM1O95202 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETM1O95202 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETM1O95202 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETM1O95202 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms