Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR5O75473 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR5O75473 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR5O75473 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR5O75473 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR5O75473 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR5O75473 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms