Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPFIA2O75334 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms