Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA3O75145 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms