Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9AO75110 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms