Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAK2O60296 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms