Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX16O60231 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DHX16O60231 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DHX16O60231 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX16O60231 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX16O60231 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms