Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP2AO43633 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP2AO43633 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms