Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBDO15205 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBDO15205 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBDO15205 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBDO15205 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBDO15205 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBDO15205 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBDO15205 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBDO15205 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms