Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A2O14975 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A2O14975 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms