Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMKR1H3BMG3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms