Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9PBE3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9PBE3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9PBE3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9PBE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9PBE3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9PBE3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms