Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN25C9JDP6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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