Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGB1P1B2RPK0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms