Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00587B1AMM8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms