Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYSRT1A8MQ03 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms