Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ3A6PVS8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms