Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms