Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6BA6NDN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6BA6NDN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms