Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XIRP2A4UGR9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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