Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PQLC2LA1A4F0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms