Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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