Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms