Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP11Q9Y3A2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms