Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC9Q9Y397 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms