Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC2Q9Y2U9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC2Q9Y2U9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC2Q9Y2U9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC2Q9Y2U9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC2Q9Y2U9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC2Q9Y2U9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms