Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNQ9UQP3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNQ9UQP3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms