Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms