Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms