Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRHL1Q9NZI5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRHL1Q9NZI5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms