Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ARFGAP1-211ENST00000519531 1490 ntTSL 321.83■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 519.63■□□□□ 0.731e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 318.7■□□□□ 0.581e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 518.56■□□□□ 0.561e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 518.5■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 417.31■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 317.27■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 516.07■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 313.69□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 311.6□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 56.94□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.695e-21■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 533.37■■■□□ 2.937e-10■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)27.58■■■□□ 27e-10■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-10■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 26.42□□□□□ -1.381e-323■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4A2-217ENST00000475409 802 ntTSL 26.32□□□□□ -1.41e-323■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 55.87□□□□□ -1.471e-323■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 25.72□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.849e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)27.18■■□□□ 1.949e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 226.59■■□□□ 1.859e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 526.59■■□□□ 1.859e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 525.24■■□□□ 1.639e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.629e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.489e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 522.91■■□□□ 1.269e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.019e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.89e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.659e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.69e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-202ENST00000418385 574 ntTSL 418.67■□□□□ 0.589e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 518.56■□□□□ 0.569e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.49e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.369e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 317.05■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 315.93■□□□□ 0.149e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 215.84■□□□□ 0.139e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 315.64■□□□□ 0.099e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -09e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.029e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SIAH1-207ENST00000568007 2683 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.139e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 310.29□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 410.28□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SIAH1-204ENST00000563745 589 ntTSL 410.08□□□□□ -0.89e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZNF644-210ENST00000495966 820 ntTSL 39.08□□□□□ -0.969e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-209ENST00000507665 1143 ntTSL 28.52□□□□□ -1.059e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 57.04□□□□□ -1.289e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.359e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.399e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.739e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-211ENST00000515638 738 ntTSL 53.03□□□□□ -1.929e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-205ENST00000504472 588 ntTSL 42.99□□□□□ -1.939e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 EIF4E-210ENST00000511644 686 ntTSL 52.69□□□□□ -1.989e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 32.25□□□□□ -2.059e-6■□□□□ 9.6
AATFQ9NY61 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.54□□□□□ -2.323e-56■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.232e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 218.65■□□□□ 0.582e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-233ENST00000602338 693 nt14.7□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 413.77□□□□□ -0.212e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 411.4□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 39.85□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 ZNF692-207ENST00000468455 644 ntTSL 521.89■■□□□ 1.097e-13■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 UBAC1-203ENST00000471163 838 ntTSL 319.96■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 9.5
AATFQ9NY61 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.16□□□□□ -1.421e-323■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 EIF4A2-213ENST00000465792 734 ntTSL 23.55□□□□□ -1.841e-323■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.111e-323■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.438e-7■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.178e-7■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.118e-7■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-218ENST00000492988 854 ntTSL 520.45■□□□□ 0.868e-7■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-220ENST00000494820 1098 ntTSL 519.09■□□□□ 0.658e-7■□□□□ 9.4
AATFQ9NY61 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.528e-7■□□□□ 9.4
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