Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms