Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A20Q9NP91 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A20Q9NP91 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms