Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCX3AQ9NNX9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms