Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGNBP2Q9H3C7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGNBP2Q9H3C7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGNBP2Q9H3C7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGNBP2Q9H3C7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GGNBP2Q9H3C7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGNBP2Q9H3C7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGNBP2Q9H3C7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms