Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2OQ9C0C9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms