Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP2-1Q9BYU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms