Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms